抽象的な

必須かつ極めて重要な生物学的プロセスと相関する分子間の遺伝子発現プロファイルの分析と比較は、化学療法や放射線療法への耐性、再発のリスク、転移の予測などに関する重要な情報を提供するため、がん研究において極めて重要です。本研究では、遺伝子発現プロファイルを使用して、大腸がん患者の血液サンプル中の大腸がん細胞株を正常細胞およびがん細胞から効率的に識別し、さまざまな種類の消化器がんを分類します。具体的には、血液サンプルは正常ドナーと大腸がん患者から採取しました。末梢血単核細胞を分離し、50を超える遺伝子について遺伝子発現分析を行いました。同じアッセイを、さまざまな種類の消化器がんを代表する市販のがん細胞株に対しても行いました。遺伝子発現プロファイルの比較が、がんと正常状態の間、およびさまざまながんの種類間の徹底的な識別につながるかどうかを調べるために、階層的アルゴリズムとk平均法アルゴリズムに基づくクラスタリング分析を行いました。クラスタリング分析により、a) 結腸患者のサンプルから結腸がん細胞株、b) 結腸がんサンプルから正常、c) 肝臓と結腸のタイプに基づいて胃がんと膵臓がんを効率的に分離しました。遺伝子発現プロファイルの活用は、正常サンプルとがんサンプルの区別や、さまざまな種類のがんの分類に効果的に使用できます。これはもちろん、血流から分離された細胞に基づく迅速な区別を可能にし、組織検査や特殊な機器を必要とするプロトコルを必要としないため、がん管理に重要な意味を持ちます。

キーワード: クラスタリング分析、消化管癌、末梢血単核細胞、qRT-PCR。